胃疼总在深夜一二点钟痛可能是生理原因，或胃食管反流、十二指肠溃疡等病理原因造成。
一、生理原因
可能是经常晚睡、熬夜，同时在深夜有暴饮暴食的现象，导致胃消化负担过重引起。保持饮食、作息规律，症状通常会逐渐恢复。
二、病理原因
1、胃食管反流
还可能是有胃食管反流，夜间因为体位改变，导致胃食管抗反流屏障、食管黏膜防御功能进一步下降，造成胃内容物反流引起。如果疼痛比较轻，一般可在医生的指导下使用法莫替丁片、奥美拉唑肠溶片、雷贝拉唑肠溶片等抑酸剂，减少胃酸分泌，进行改善。如果疼痛经常比较剧烈，需要及时采取手术，比如胃体折叠术、胃固定术等，抑制食物反流，改善病情。
2、十二指肠溃疡
可能是感染幽门螺杆菌、胃酸分泌异常等，导致十二指肠球部发生消化性溃疡，引起十二指肠溃疡，同时经常在深夜进食过多，引起餐后疼痛造成。如果不伴有大出血、急性穿孔等情况，通常可采取药物治疗进行改善。比如为胃酸分泌异常使胃酸分泌比较多造成，一般可遵医嘱使用奥美拉唑肠溶片、法莫替丁片、雷尼替丁胶囊等H2受体拮抗剂，减轻胃酸对胃黏膜的刺激，进行改善。
另外，可能是慢性胰腺炎等造成，建议及时采取相关治疗，改善病情。
