一般情况下，达托霉素和万古霉素存在使用方法不同、作用机制不同、抗菌活性不同的区别。具体分析如下：
1、使用方法不同
达托霉素通常为注射液，一般以静脉注射的方式给药，而万古霉素可分为片剂和注射剂，可通过口服或静脉注射给药。
2、作用机制不同
达托霉素通过破坏细菌细胞膜而发挥其抗菌作用，而万古霉素通过干扰细菌细胞壁的合成而杀死细菌。
3、抗菌活性不同
达托霉素对革兰阴性菌和厌氧菌治疗效果相对欠佳，而万古霉素对革兰阴性菌同样没有太大的治疗效果，所以在选择药物之前，应明确细菌感染的类型。
除以上相对常见的区别外，二者之间还存在耐药性的影响不同、药物的代谢程度不同、药物的副作用不同等区别。因此，在选择使用哪种抗生素时，患者需要根据自身的具体情况、细菌的耐药性和药物可能会产生的副作用等因素进行综合考虑。
