早晨起来感觉腰和小腹疼可能是生理因素导致的，也可能是病理因素导致的，如盆腔炎、慢性胃炎等。具体分析如下：
一、生理因素
如果在前一天进行过于剧烈的体育活动，造成腰部以及小腹部肌肉拉伤，便可能产生早上起来感觉腰和小腹疼的症状，属于正常生理现象，可以通过适当的卧床休息进行缓解。
二、病理因素
1、盆腔炎
沙眼衣原体、淋病奈瑟菌、金黄色葡萄球菌等感染，都可能引发盆腔炎，使盆腔部位在炎症因子的刺激下出现上述症状，患者可以遵医嘱使用盐酸左氧氟沙星胶囊、甲硝唑片等药物进行治疗。
2、慢性胃炎
病菌感染是引发慢性胃炎的主要因素，患者胃部黏膜在病菌的侵袭下，可能会出现破损情况，伴有该症状。可以遵医嘱使用奥美拉唑肠溶片、雷贝拉唑钠肠溶胶囊等药物进行治疗。
除此之外，早晨起来感觉腰和小腹疼可能是膀胱炎、宫颈炎、子宫肌瘤等导致的。建议在进行治疗期间积极配合。
