一般情况下，豆芽根部发黑了不能吃。
一般豆芽头部的茎部呈现绿色或白绿色，若豆芽因光照、氧化反应等原因，使豆芽的颜色可能会变为红色、黄色等情况，属于正常现象，不会影响食用。但豆芽根部发黑，说明豆芽发生变质，不能再继续食用，误食后可能会造成食用者出现腹痛、腹泻、呕吐等胃肠道不适症状。
建议可以将没有吃完的豆芽用保鲜盒或保鲜袋进行密封，放置于冰箱内，能延长豆芽存放的保质期。购买豆芽尽量要按自身的需求购买，避免购买过多，导致长时间存放，出现变质的情况。日常也要注意饮食的卫生和饮食结构，保证自身的营养均衡。同时在日常生活中多摄入牛奶、鸡蛋、瘦肉等营养比较丰富蛋白质较高的食物，避免过多的食用辛辣刺激性食物。
