检查骨关节结核，首先要通过体格检查。患有骨关节结核的患者，通过查体可以发现关节肿胀、局部压痛，关节活动范围明显受限。
如果已经形成寒性脓肿，可以抽取脓液，进行结核杆菌培养，阳性结果可以确定诊断。血常规检查，可以发现红细胞降低、血红蛋白减少。在骨关节结核活动期，血沉会明显加快，也有助于诊断。X光片一般在发病两个月后才有改变，因此，早期X光片只能作为鉴别诊断的方法。
早期诊断主要通过磁共振，可以发现病变部位的骨质内有异常信号。在后期，X光片可以发现寒性脓肿、椎旁脓肿以及流注脓肿，还可以发现骨质破坏和硬化的死骨。关节镜下采集滑膜组织进行活检，也可以确诊关节结核。
