高压氧舱治疗，一般没有什么明显的后遗症。高压氧舱治疗主要是通过高浓度的氧分压，给予患者治疗，对一氧化碳中毒、脑血管病、突发性耳聋、伤口不愈合、厌氧菌感染、股骨头坏死等等有较好的效果。临床上常规高压氧治疗在压力和时间上是有一定限制的，所以可能产生的不良反应概率比较低。
临床上最常见的就是中耳气压伤，所以做高压氧的时候一般要保证患者咽鼓管是通畅的。可以捏住鼻子进行鼓气或通过吞咽动作，调整鼓膜内外压力平衡，能够避免出现中耳气压伤，即使出现轻中度中耳气压伤，比如耳痛，经过几天休息可以完全恢复。
再一个是减压病，往往是在潜水作业中可能常见，临床常用的治疗压力下，一般不会出现减压病。如果做高压氧时间过长，有可能造成氧中毒，但目前常规的高压氧舱治疗都在短时间内完成，氧中毒的可能性不大。
