吞咽口水喉咙痛左后脑痛可能是生理因素，也可能是病理因素导致，如扁桃体炎、咽喉炎等。需要根据不同的情况进行治疗。
一、生理因素
长期精神压力过大、焦虑、紧张、疲劳、劳累，会引起吞咽唾液时对周边神经产生刺激，引起后脑勺疼痛。一般不需要特殊治疗，应注意休息，避免过度劳累，可自行缓解。
二、病理因素
1、扁桃体炎
一般是由于感染引起的，以咽痛为主，常伴有头痛、咽喉干燥等症状，容易出现并发症，比如吞咽唾液后的后脑勺疼痛。可根据医师的建议服用阿莫西林胶囊、阿莫西林克拉维酸钾片等进行治疗。如果周边组织出现水肿，可以在医生指导下服用地塞米松片进行消肿。如果口服药物没有明显的改善，可以通过静脉注射青霉素、头孢类抗生素，配合雾化吸入。
2、咽喉炎
由于病毒或细菌感染所致，出现咽喉部灼热、发痒、咽喉肿痛等症状，严重者会出现头痛、发热等全身症状，还会出现吞咽唾液后的脑勺疼痛。可在医生指导下服用青霉素片、阿莫西林胶囊、利巴韦林片等药物进行治疗。
此外，吞咽口水喉咙痛左后脑痛也可能是颈椎病导致。建议患者如果身体有什么不舒服的地方，应及时就医。
