连续吃了两次紧急避孕药肚子疼可能是生理因素导致的，也可能是病理因素导致的，如胃肠道反应、子宫内膜改变等，需要进行针对性治疗，具体分析如下：
一、生理因素
女性服用紧急避孕药后，可能会出现紧张或焦虑的情绪，从而引起小腹痛，因此，服用避孕药后不要过度紧张，注意放松心情，避免心理压力过大，加重不适症状。
二、病理因素
1、胃肠道反应
紧急避孕药中含有大量的激素，可能会对胃肠道造成刺激，从而出现这种现象。可以在医生的指导下服用奥美拉唑肠溶胶囊、雷尼替丁片等药物保护胃黏膜，缓解不适。
2、子宫内膜改变
紧急避孕药中的激素会使子宫内膜增厚、收缩以及脱落，过程中可能会导致小腹疼痛，因此就会表现出这种现象。可以在医生的指导下服用布洛芬缓释片、对乙酰氨基酚片等药物缓解疼痛。
除上述外，盆腔炎、附件炎、阑尾炎等都会导致这种现象出现，建议根据病因采取针对性治疗。
