含氟牙膏可能会引起龋齿，降低牙齿的抗酸能力。
氟进入机体后主要在骨骼和牙齿上形成一层保护膜，可防止牙齿在生长发育过程中由于各种原因导致的龋齿。龋病治疗需要在医生指导下用氟封闭剂、氟化合物、复合树脂充填剂进行治疗。当氟与钙结合成氟化钙后，就会降低牙齿的抗酸能力，如果不小心吃了酸性食物会有酸痛感，甚至导致牙酸骨痛，因为牙组织中的酸蚀牙釉质不能抵御外界食物中的酸，最终导致酸蚀牙骨质。可以用牙缝刷、纱布等清洁牙齿表面，避免吃酸性食物，定期到医院检查牙齿等。
除此之外，如果长期过量使用含氟牙膏，可能会引起氟中毒，从而损害神经系统，引发骨质疏松症等。主要表现为腰腿痛、骨关节疼痛而僵直、骨骼变形及脊神经根受压迫，伴有下肢骨骼肌损害，出现肌肉萎缩，不利于身体健康。
