蹲下起来膝盖后面的腿窝筋酸疼，可能与生理性因素有关，也可能是半月板损伤、腘窝囊肿等病理性因素引起。
一、生理性因素
如果平时站立或行走时间比较长，或腘窝部位受凉，容易影响局部血液循环，从而导致局部的肌腱或韧带的无菌性炎症，出现腿窝筋酸疼的情况。应注意减少活动，避免劳累，注意保暖。
二、病理性因素
1、半月板损伤
蹲下起来膝盖后面的腿窝筋酸疼，不排除与存在半月板损伤有关，可能是长期使用膝关节导致，建议到医院做磁共振检查。平时应注意避免剧烈活动，严重时可以在医生指导下进行关节镜微创手术修补半月板或进行半月板置换术。
2、腘窝囊肿
大部分腘窝囊肿者，无明显不适症状，部分情况下可因膝关节过量活动或负荷性刺激腘窝囊肿，导致局部疼痛甚至是囊肿增大。如果因腘窝囊肿引起的疼痛症状比较严重，需要及时就医，在医生建议下进行手术切除囊肿。
除以上原因外，还可能是腰椎间盘突出症导致的。患者平时应注意休息，减轻膝关节的负荷，不要继续进行下蹲的运动。
