小檗碱一般指的是盐酸小檗碱片，拉肚子指腹泻。腹泻吃了两天盐酸小檗碱片还不好可能是药物剂量不足、药不对症导致，可根据不同原因选择不同处理方法。
1、药物剂量不足
如果是患者治疗时药物使用剂量不足导致，可在医生指导下足量用药，一般调整用药后，症状会有所改善。
2、药不对症
盐酸小檗碱片属于消炎止泻药物，一般适用于治疗肠道感染引起的腹泻，但对于慢性结肠炎、溃疡性结肠炎等引起的腹泻，属于药不对症。建议在医生指导下根据不同病因选择不同药物，比如慢性结肠炎，肠道长期受到炎症刺激导致，可在医生指导下使用蒙脱石散、盐酸洛哌丁胺胶囊、复方地芬诺酯片等药物，促进消化道黏膜修复，减少肠蠕动，缓解腹泻现象。溃疡性结肠炎导致可遵医嘱用盐酸左氧氟沙星胶囊、注射用盐酸万古霉素、头孢克肟胶囊等抗生素药物进行治疗，减轻感染。若并发肠梗阻、肠大出血等情况，药物治疗不理想，可根据医生建议选择结肠切除术治疗。
出现以上症状时，建议患者及时就诊，明确病因后遵医嘱治疗。
