果糖进入体内以后会通过GLUT5被吸收到肠上皮细胞当中，然后部分果糖会在肠细胞内被己酮糖激酶磷酸化，并且会转化为乳酸、甘油酸、葡萄糖或者其他有机酸等，然后会通过门静脉进入肝脏，在进入门静脉时，果糖的浓度可能会短暂的升高，到达肝脏以后果糖会通过GLUT2有效的转入肝细胞，并被己酮糖激酶酸化，然后用于葡萄糖生产、脂肪生成以及糖原合成和功能。
果糖在代谢时一般不受胰岛素的控制，在正常人体当中，仅有少量葡萄糖会从肝脏释放出，所以人体摄入葡萄糖以后一般不会与摄入蔗糖、葡萄糖等引起严重饭后高血糖或者低血糖的情况。另外，果糖在体内一般不会产生乳酸，所以不会引起肌肉酸痛的情况。
